Бишимбаев признан виновным по ст. 120 ч. 2 УК РК — «Иные насильственные действия сексуального характера, совершенные в отношении беспомощного лица, повлекшие по неосторожности смерть потерпевшего».
В 2022 г. в ходе расследования дела о многомилионных хищениях в жилищном строительстве в отношении Бишимбекова выдвинули обвинения в получении взятки в особо крупном размере.
По данным следствия в 2016 г., будучи председателем правления АО "НУХ "Байтерек", Бишимбаев лично получил более $2 млн. взятки от представителей компании ТОО "Тулпар Инжиниринг".
Посредником в передаче денег являлся друг Бишимбекова — Арман Джумагелдиев.
Кроме того против Бишимбекова было возбуждено уголовное дело по ч.3 ст.361 УК — «Бездействие по службе, повлекшее тяжкие последствия»
Его обвинили в том, что в период с 2016 по 2017 год, будучи министром национальной экономики, он не предпринял мер по предотвращению нарушений закона со стороны:
- АО «Банк Развития и Реконструкции Казахстана»
- АО «Экспортно-Страховой Компании «Kazakh Export»
-АО «Национальный управляющий холдинг «Астана ЭКСПО — 2017»
Что причинило ущерб государству на сумму более 400 млн. тенге.
Это не первый случай в Казахстане, когда министра уличают в коррупции.
До Бишимбекова в 2008 г. за коррупцию осудили экс-Премьер-министра Казахстана Акежана Кажегелдина. В 2010 г. он получил политическое убежище в Соединённых Штатах Америки.
Супруга К. Бишимбекова, А.Ш.А., погибла 1 апреля 2015 г. в результате нанесённых ей тяжких телесных повреждений. Согласно информации СМИ она жаловалась на головные боли и головокружение, однако за медицинской помощью она не обратилась.
По данным следствия Бишимбеков нанёс супруге множественные удары тяжёлым предметом в область головы, а также в область туловища. От полученных повреждений женщина скончалась.